醫療器械的性質和預期用途在一定程度上決定了無菌包裝所采取的滅菌方式，而不同的滅菌方式又影響著包裝系統材料的采用，醫用包裝如何確定滅菌方式？例如:高吸附性物品不適于環氧乙烷滅菌(如:紗布、棉制品、木制品等);含PE件的醫療器械，不耐高溫，不適于高壓蒸汽滅菌;昂貴的器械可能會選擇滅菌周期短的滅菌方式，以提高使用頻率等。醫療器械性質本身在一定程度上也決定了應采取的無菌包裝系統，例如:需穿透才能達到滅菌效果的物品應采用透氣性良好的無菌包裝;滅菌后立即使用的醫療器械，如在無菌室滅菌，可裸包裝。

  環氧乙烷滅菌裝置是一次性使用無菌醫療器械生產企業的關鍵設備，安裝操作、使用管理有其特殊要求，使用環氧乙烷做滅菌劑， 環氧乙烷是一種廣譜滅菌劑，可在常溫下殺滅各種微生物，包括芽孢、結核桿菌、細菌、病毒等。環氧乙烷不損害滅菌的物品且穿透力很強，故多數不宜用一般方法滅菌的物品均可用環氧乙烷消毒和滅菌。例如，電子儀器、光學儀器、醫療器械、書籍、文件、皮毛、棉、化纖、塑料制品、木制品、陶瓷及金屬制品、內鏡、透析器和一次性使用的診療用品等。環氧乙烷是目前主要的低溫滅菌方法之一。

  輻照滅菌，是利用核輻射原理通過利用原子能射線的能量引起微生物死亡，從而達到殺菌的目的，具有滅菌徹底，無毒、綠色環保、低能耗、節約能源的優點。商業上多利用鈷-60 γ射線和電子加速器產生的電子束來進行輻照滅菌，常用于透析器的滅菌（產品外殼原料需采用防輻射牌號的PC）。輻照滅菌是一種帶有破壞性的滅菌方式，不能耐受輻照滅菌的材料經滅菌后，會產生活性自由基并發生化學反應，使材料發生降解，進而發黃變脆，為了彌補此缺陷，就需要在塑料中添加更多的添加劑以抵抗輻照射線的影響。但不可避免的是材料本身會存在一定程度上的小分子降解析出，從而被吸附劑或纖維膜吸附，而且更多含量的添加劑存在被吸附劑或纖維膜溶出的風險。

  濕熱滅菌的原理是使微生物的蛋白質及核酸變形導致其死亡。這種變形首先是分子中的氫鍵分裂，當氫鍵斷裂時，蛋白質及核酸內部結構被破壞，進而喪失了原有功能，指用飽和水蒸氣、沸水或流通蒸汽進行滅菌的方法，以高溫高壓水蒸氣為介質，由于蒸汽潛熱大，穿透力強，容易使蛋白質變性或凝固，后導致微生物的死亡，所以該法的滅菌效率比干熱滅菌法高，是藥物制劑生產過程中常用的滅菌方法。